Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnfP06804 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnfP06804 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnfP06804 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TnfP06804 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnfP06804 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnfP06804 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnfP06804 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnfP06804 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnfP06804 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnfP06804 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnfP06804 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnfP06804 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TnfP06804 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TnfP06804 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TnfP06804 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TnfP06804 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TnfP06804 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TnfP06804 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms