Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P04212 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P04212 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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