Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P01644 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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P01644 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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P01644 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P01644 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P01644 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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