Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgceO70258 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgceO70258 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgceO70258 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgceO70258 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgceO70258 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SgceO70258 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SgceO70258 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SgceO70258 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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