Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sdc4O35988 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sdc4O35988 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sdc4O35988 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sdc4O35988 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sdc4O35988 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sdc4O35988 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sdc4O35988 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sdc4O35988 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Sdc4O35988 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Sdc4O35988 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Sdc4O35988 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Sdc4O35988 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sdc4O35988 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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