Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nek2O35942 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nek2O35942 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Nek2O35942 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Nek2O35942 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Nek2O35942 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms