Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sp100O35892 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Sp100O35892 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Sp100O35892 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Sp100O35892 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Sp100O35892 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Sp100O35892 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Sp100O35892 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Sp100O35892 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sp100O35892 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms