Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cited2O35740 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms