Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prrt1O35449 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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