Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Cnih1O35372 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Cnih1O35372 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Cnih1O35372 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Cnih1O35372 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Cnih1O35372 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Cnih1O35372 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Cnih1O35372 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Cnih1O35372 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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