Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
KeraO35367 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KeraO35367 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KeraO35367 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KeraO35367 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
KeraO35367 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KeraO35367 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
KeraO35367 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
KeraO35367 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KeraO35367 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KeraO35367 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
KeraO35367 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
KeraO35367 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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