Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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ColqO35348 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms