Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Dgcr6O35347 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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Dgcr6O35347 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Dgcr6O35347 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Dgcr6O35347 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Dgcr6O35347 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Dgcr6O35347 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Dgcr6O35347 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Dgcr6O35347 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Dgcr6O35347 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Dgcr6O35347 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Dgcr6O35347 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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