Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms