Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tcof1O08784 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tcof1O08784 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Tcof1O08784 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tcof1O08784 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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