Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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