Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms