Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3278L7N2D2 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3278L7N2D2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms