Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
BC117090L7N257 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms