Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm21310J3QQ23 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms