Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm379J3QQ19 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Gm379J3QQ19 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Gm379J3QQ19 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Gm379J3QQ19 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm379J3QQ19 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm379J3QQ19 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm379J3QQ19 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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