Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17535J3KMR8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17535J3KMR8 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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