Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms