Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20815J3KMI0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20815J3KMI0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms