Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Usp17ldG5E8G2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms