Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M1F7CXU4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M1F7CXU4 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M1F7CXU4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M1F7CXU4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M1F7CXU4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M1F7CXU4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-M1F7CXU4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-M1F7CXU4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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H2-M1F7CXU4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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