Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Zfp988F6VKC7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Zfp988F6VKC7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Zfp988F6VKC7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Zfp988F6VKC7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Zfp988F6VKC7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Zfp988F6VKC7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Zfp988F6VKC7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Zfp988F6VKC7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Zfp988F6VKC7 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
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