Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc85cE9Q6B2 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms