Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm20518E9Q548 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm20518E9Q548 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Gm20518E9Q548 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm20518E9Q548 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm20518E9Q548 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm20518E9Q548 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm20518E9Q548 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm20518E9Q548 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm20518E9Q548 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Gm20518E9Q548 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm20518E9Q548 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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