Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Syde2E9PUP1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms