Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms