Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmf1B9EKI3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmf1B9EKI3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms