Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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PtprbB2RU80 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtprbB2RU80 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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