Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm8048-201ENSMUST00000182555 996 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Prr29B1ARI9 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Prr29B1ARI9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Prr29B1ARI9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Prr29B1ARI9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Prr29B1ARI9 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Prr29B1ARI9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Prr29B1ARI9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Prr29B1ARI9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prr29B1ARI9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prr29B1ARI9 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prr29B1ARI9 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prr29B1ARI9 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms