Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms