Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

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Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm5938A2AEN9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm5938A2AEN9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Gm5938A2AEN9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm5938A2AEN9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm5938A2AEN9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm5938A2AEN9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm5938A2AEN9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm5938A2AEN9 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Gm5938A2AEN9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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