Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms