Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hdac5Q9Z2V6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms