Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nek4Q9Z1J2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nek4Q9Z1J2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms