Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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