Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn13Q9Z0S4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Cldn13Q9Z0S4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn13Q9Z0S4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn13Q9Z0S4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn13Q9Z0S4 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Cldn13Q9Z0S4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cldn13Q9Z0S4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Cldn13Q9Z0S4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cldn13Q9Z0S4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms