Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Pfdn5Q9WU28 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pfdn5Q9WU28 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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