Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ercc4Q9QZD4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ercc4Q9QZD4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ercc4Q9QZD4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ercc4Q9QZD4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ercc4Q9QZD4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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