Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP6

Mkrn1, E3 ubiquitin-protein ligase makorin-1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn1Q9QXP6 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mkrn1Q9QXP6 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms