Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rabgef1Q9JM13 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Rabgef1Q9JM13 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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