Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hmgn5Q9JL35 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Hmgn5Q9JL35 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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