Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms