Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clstn2Q9ER65 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clstn2Q9ER65 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms