Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ndufs3Q9DCT2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms