Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Tspan4Q9DCK3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tspan4Q9DCK3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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